Chociaż leczenie endodontyczne mikroskopem jest zazwyczaj całkowicie starannym zabiegiem, niekiedy z powodu rozwijających zmian choroby potrzebne jest powtórne leczenie endodontyczne . W większości takich sytuacji należy zdecydować się na próbę zachowania swojego zęba. Usunięcie zęba skutkuje pojawieniem się nieestetycznej luki, jaką trzeba wypełnić nie tylko ze względu na piękno uśmiechu. Brak zęba wywołuje postępujący zanik kości, a do tego prowadzi do ruszania się przyległych i przeciwstawnych zębów, jakim brak wymaganego oparcia. Ponadto wypełnienie luki zębowej skutkuje dodatkowym kosztem jakim jest wstawienie uzupełnienia protetycznego. Niezależnie od tego, czy wybierzemy implant zębowy czy np. most , oznacza to następne wizyty w gabinecie dentystycznym i ciągłe leczenie.
Dlatego nawet kiedy ząb był już leczony kanałowo wcześniej, warto rozważyć ponowne leczenie endodontyczne. Choć ponowny zabieg, może stać się cięższy niż pierwszy, doświadczony stomatolog endodonta, zrobi co w jego mocy, aby przeprowadzić zabieg poprawnie. Wznowione leczenie kanałowe przeprowadza się zwykle, kiedy zostaną kanały niedoleczone przy wcześniejszym zabiegu, dlatego że np. nie zostały one dostrzeżone. Pomoc stomatologa endodonty potrzebna jest także w przypadku perforacji komory albo korzenia zęba i gdy w kanale utkwiło narzędzie stomatologiczne. Ekstrakcja zęba zazwyczaj następuje tylko wtedy, kiedy nie ma możliwości dobrego opracowania kanału.