Choć leczenie endodontyczne z mikroskopem jest zazwyczaj w pełni dokładnym zabiegiem, zdarza się z powodu rozwijających stadiów choroby potrzebne jest ponowne leczenie endodontyczne . W znakomitej większości przypadków należy podejmować się ratowania naturalnego zęba. Usunięcie zęba oznacza pojawienie się niekomfortowej luki, którą trzeba wypełnić nie tylko ze względu na estetykę uśmiechu. Brak zęba wpływa na stopniowy zanik kości, a do tego prowadzi do rozchwiania, a nawet wypadania sąsiednich zębów, jakim brak właściwego oparcia. Co więcej uzupełnienie luki zębowej skutkuje nowym kosztem w postaci protezy. Niezależnie od tego, czy wybierzemy implant zęba czy np. most protetyczny, oznacza to nowe wizyty w klinice stomatologicznej i ciągłe leczenie.

Dlatego nawet jeśli ząb był już leczony uprzednio, powinno się przemyśleć ponowne leczenie endodontyczne. Choć ponowny zabieg, może być bardziej skomplikowany niż pierwszy, doświadczony dentysta endodonta, postara się, aby wykonać leczenie poprawnie. Powtórne leczenie kanałowe wykonuje się z reguły, jeśli znajdą się kanały niewyleczone przy pierwszym podejściu, ponieważ np. nie zostały one wtedy zauważone. Reakcja stomatologa endodonty wymagana jest również w przypadku perforacji korzenia lub komory zęba oraz jeśli w kanale zostało narzędzie dentystyczne. Usunięcie zęba przeważnie zaleca się tylko wówczas, jeśli nie ma możliwości prawidłowego opracowania kanału.